El objetivo principal del proyecto AQUASERS es la investigación y desarrollo en cooperación de nuevas soluciones biotecnológicas integradas en un dispositivo autómata para la monitorización de la calidad del agua, a través de la monitorización de Legionella pneumophila y parámetros fisicoquímicos, para la prevención y vigilancia de la legionelosis en ambientes industriales y hospitalarios, sector ocio y turismo, así como puntos de abastecimiento de aguas de red.​

 En concreto, los objetivos incluyen: ​